Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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Mrpl40Q9Z2Q5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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