Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms