Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KIF3AQ9Y496 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KIF3AQ9Y496 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KIF3AQ9Y496 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KIF3AQ9Y496 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KIF3AQ9Y496 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KIF3AQ9Y496 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KIF3AQ9Y496 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KIF3AQ9Y496 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KIF3AQ9Y496 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KIF3AQ9Y496 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
KIF3AQ9Y496 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
KIF3AQ9Y496 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KIF3AQ9Y496 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KIF3AQ9Y496 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KIF3AQ9Y496 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KIF3AQ9Y496 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KIF3AQ9Y496 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KIF3AQ9Y496 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
KIF3AQ9Y496 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
KIF3AQ9Y496 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KIF3AQ9Y496 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KIF3AQ9Y496 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KIF3AQ9Y496 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KIF3AQ9Y496 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KIF3AQ9Y496 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KIF3AQ9Y496 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KIF3AQ9Y496 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KIF3AQ9Y496 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KIF3AQ9Y496 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KIF3AQ9Y496 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KIF3AQ9Y496 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KIF3AQ9Y496 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KIF3AQ9Y496 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KIF3AQ9Y496 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
KIF3AQ9Y496 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KIF3AQ9Y496 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KIF3AQ9Y496 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KIF3AQ9Y496 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KIF3AQ9Y496 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KIF3AQ9Y496 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KIF3AQ9Y496 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KIF3AQ9Y496 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KIF3AQ9Y496 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KIF3AQ9Y496 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KIF3AQ9Y496 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KIF3AQ9Y496 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KIF3AQ9Y496 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KIF3AQ9Y496 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KIF3AQ9Y496 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KIF3AQ9Y496 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
KIF3AQ9Y496 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KIF3AQ9Y496 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KIF3AQ9Y496 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KIF3AQ9Y496 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
KIF3AQ9Y496 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KIF3AQ9Y496 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KIF3AQ9Y496 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KIF3AQ9Y496 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KIF3AQ9Y496 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KIF3AQ9Y496 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KIF3AQ9Y496 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KIF3AQ9Y496 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KIF3AQ9Y496 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KIF3AQ9Y496 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KIF3AQ9Y496 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KIF3AQ9Y496 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
KIF3AQ9Y496 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KIF3AQ9Y496 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KIF3AQ9Y496 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KIF3AQ9Y496 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KIF3AQ9Y496 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KIF3AQ9Y496 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KIF3AQ9Y496 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KIF3AQ9Y496 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KIF3AQ9Y496 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KIF3AQ9Y496 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KIF3AQ9Y496 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KIF3AQ9Y496 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KIF3AQ9Y496 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
KIF3AQ9Y496 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIF3AQ9Y496 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KIF3AQ9Y496 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KIF3AQ9Y496 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KIF3AQ9Y496 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KIF3AQ9Y496 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KIF3AQ9Y496 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KIF3AQ9Y496 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KIF3AQ9Y496 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KIF3AQ9Y496 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KIF3AQ9Y496 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KIF3AQ9Y496 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KIF3AQ9Y496 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KIF3AQ9Y496 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KIF3AQ9Y496 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KIF3AQ9Y496 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KIF3AQ9Y496 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KIF3AQ9Y496 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KIF3AQ9Y496 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KIF3AQ9Y496 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms