Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Six6Q9QZ28 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Six6Q9QZ28 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Six6Q9QZ28 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Six6Q9QZ28 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Six6Q9QZ28 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Six6Q9QZ28 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Six6Q9QZ28 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Six6Q9QZ28 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Six6Q9QZ28 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Six6Q9QZ28 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Six6Q9QZ28 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Six6Q9QZ28 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Six6Q9QZ28 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Six6Q9QZ28 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Six6Q9QZ28 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Six6Q9QZ28 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Six6Q9QZ28 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Six6Q9QZ28 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Six6Q9QZ28 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Six6Q9QZ28 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Six6Q9QZ28 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Six6Q9QZ28 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Six6Q9QZ28 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Six6Q9QZ28 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Six6Q9QZ28 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Six6Q9QZ28 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Six6Q9QZ28 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Six6Q9QZ28 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Six6Q9QZ28 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Six6Q9QZ28 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Six6Q9QZ28 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Six6Q9QZ28 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Six6Q9QZ28 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Six6Q9QZ28 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Six6Q9QZ28 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Six6Q9QZ28 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Six6Q9QZ28 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Six6Q9QZ28 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Six6Q9QZ28 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Six6Q9QZ28 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Six6Q9QZ28 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Six6Q9QZ28 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Six6Q9QZ28 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Six6Q9QZ28 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Six6Q9QZ28 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Six6Q9QZ28 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Six6Q9QZ28 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Six6Q9QZ28 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Six6Q9QZ28 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Six6Q9QZ28 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Six6Q9QZ28 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Six6Q9QZ28 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Six6Q9QZ28 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Six6Q9QZ28 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Six6Q9QZ28 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Six6Q9QZ28 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Six6Q9QZ28 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Six6Q9QZ28 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Six6Q9QZ28 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Six6Q9QZ28 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Six6Q9QZ28 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Six6Q9QZ28 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Six6Q9QZ28 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Six6Q9QZ28 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Six6Q9QZ28 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Six6Q9QZ28 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Six6Q9QZ28 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Six6Q9QZ28 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Six6Q9QZ28 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Six6Q9QZ28 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Six6Q9QZ28 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Six6Q9QZ28 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Six6Q9QZ28 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Six6Q9QZ28 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Six6Q9QZ28 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Six6Q9QZ28 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Six6Q9QZ28 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Six6Q9QZ28 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Six6Q9QZ28 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Six6Q9QZ28 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Six6Q9QZ28 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Six6Q9QZ28 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Six6Q9QZ28 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Six6Q9QZ28 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Six6Q9QZ28 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Six6Q9QZ28 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Six6Q9QZ28 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Six6Q9QZ28 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Six6Q9QZ28 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Six6Q9QZ28 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Six6Q9QZ28 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Six6Q9QZ28 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Six6Q9QZ28 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Six6Q9QZ28 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Six6Q9QZ28 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Six6Q9QZ28 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Six6Q9QZ28 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Six6Q9QZ28 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Six6Q9QZ28 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms