Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N5

RBM27, RNA-binding protein 27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM27Q9P2N5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RBM27Q9P2N5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RBM27Q9P2N5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RBM27Q9P2N5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RBM27Q9P2N5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RBM27Q9P2N5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RBM27Q9P2N5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RBM27Q9P2N5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RBM27Q9P2N5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RBM27Q9P2N5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RBM27Q9P2N5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RBM27Q9P2N5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RBM27Q9P2N5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RBM27Q9P2N5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RBM27Q9P2N5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RBM27Q9P2N5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RBM27Q9P2N5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RBM27Q9P2N5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RBM27Q9P2N5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RBM27Q9P2N5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
RBM27Q9P2N5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RBM27Q9P2N5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RBM27Q9P2N5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
RBM27Q9P2N5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RBM27Q9P2N5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
RBM27Q9P2N5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RBM27Q9P2N5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RBM27Q9P2N5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RBM27Q9P2N5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RBM27Q9P2N5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RBM27Q9P2N5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RBM27Q9P2N5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RBM27Q9P2N5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RBM27Q9P2N5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RBM27Q9P2N5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RBM27Q9P2N5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RBM27Q9P2N5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RBM27Q9P2N5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RBM27Q9P2N5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RBM27Q9P2N5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RBM27Q9P2N5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RBM27Q9P2N5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RBM27Q9P2N5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RBM27Q9P2N5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RBM27Q9P2N5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RBM27Q9P2N5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RBM27Q9P2N5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RBM27Q9P2N5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RBM27Q9P2N5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RBM27Q9P2N5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RBM27Q9P2N5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RBM27Q9P2N5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RBM27Q9P2N5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RBM27Q9P2N5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RBM27Q9P2N5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RBM27Q9P2N5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RBM27Q9P2N5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RBM27Q9P2N5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RBM27Q9P2N5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RBM27Q9P2N5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RBM27Q9P2N5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RBM27Q9P2N5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RBM27Q9P2N5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RBM27Q9P2N5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RBM27Q9P2N5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RBM27Q9P2N5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RBM27Q9P2N5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RBM27Q9P2N5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RBM27Q9P2N5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RBM27Q9P2N5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RBM27Q9P2N5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RBM27Q9P2N5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RBM27Q9P2N5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RBM27Q9P2N5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RBM27Q9P2N5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RBM27Q9P2N5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RBM27Q9P2N5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RBM27Q9P2N5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RBM27Q9P2N5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RBM27Q9P2N5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RBM27Q9P2N5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RBM27Q9P2N5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RBM27Q9P2N5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RBM27Q9P2N5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RBM27Q9P2N5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RBM27Q9P2N5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
RBM27Q9P2N5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RBM27Q9P2N5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RBM27Q9P2N5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RBM27Q9P2N5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
RBM27Q9P2N5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RBM27Q9P2N5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RBM27Q9P2N5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RBM27Q9P2N5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RBM27Q9P2N5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RBM27Q9P2N5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RBM27Q9P2N5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RBM27Q9P2N5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
RBM27Q9P2N5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RBM27Q9P2N5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms