Protein–RNA interactions for Protein: Q96EL3

MRPL53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL53Q96EL3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
MRPL53Q96EL3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL53Q96EL3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL53Q96EL3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL53Q96EL3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL53Q96EL3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL53Q96EL3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL53Q96EL3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL53Q96EL3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL53Q96EL3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL53Q96EL3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL53Q96EL3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL53Q96EL3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL53Q96EL3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL53Q96EL3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL53Q96EL3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL53Q96EL3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL53Q96EL3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL53Q96EL3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL53Q96EL3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL53Q96EL3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL53Q96EL3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL53Q96EL3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL53Q96EL3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL53Q96EL3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL53Q96EL3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL53Q96EL3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL53Q96EL3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL53Q96EL3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL53Q96EL3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL53Q96EL3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL53Q96EL3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL53Q96EL3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL53Q96EL3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL53Q96EL3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL53Q96EL3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL53Q96EL3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL53Q96EL3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL53Q96EL3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL53Q96EL3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL53Q96EL3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL53Q96EL3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MRPL53Q96EL3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MRPL53Q96EL3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MRPL53Q96EL3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MRPL53Q96EL3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MRPL53Q96EL3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MRPL53Q96EL3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MRPL53Q96EL3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRPL53Q96EL3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MRPL53Q96EL3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRPL53Q96EL3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRPL53Q96EL3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRPL53Q96EL3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRPL53Q96EL3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MRPL53Q96EL3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRPL53Q96EL3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRPL53Q96EL3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRPL53Q96EL3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRPL53Q96EL3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MRPL53Q96EL3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRPL53Q96EL3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRPL53Q96EL3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRPL53Q96EL3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRPL53Q96EL3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRPL53Q96EL3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRPL53Q96EL3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRPL53Q96EL3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRPL53Q96EL3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MRPL53Q96EL3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRPL53Q96EL3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRPL53Q96EL3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MRPL53Q96EL3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRPL53Q96EL3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRPL53Q96EL3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRPL53Q96EL3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRPL53Q96EL3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRPL53Q96EL3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRPL53Q96EL3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRPL53Q96EL3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRPL53Q96EL3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRPL53Q96EL3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRPL53Q96EL3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRPL53Q96EL3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRPL53Q96EL3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRPL53Q96EL3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MRPL53Q96EL3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRPL53Q96EL3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRPL53Q96EL3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRPL53Q96EL3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRPL53Q96EL3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRPL53Q96EL3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRPL53Q96EL3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRPL53Q96EL3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRPL53Q96EL3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRPL53Q96EL3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRPL53Q96EL3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRPL53Q96EL3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRPL53Q96EL3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRPL53Q96EL3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms