Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN0

ATG4A, Cysteine protease ATG4A, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4AQ8WYN0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ATG4AQ8WYN0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATG4AQ8WYN0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATG4AQ8WYN0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATG4AQ8WYN0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATG4AQ8WYN0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATG4AQ8WYN0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATG4AQ8WYN0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATG4AQ8WYN0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATG4AQ8WYN0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ATG4AQ8WYN0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATG4AQ8WYN0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATG4AQ8WYN0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATG4AQ8WYN0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATG4AQ8WYN0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATG4AQ8WYN0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATG4AQ8WYN0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATG4AQ8WYN0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATG4AQ8WYN0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATG4AQ8WYN0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATG4AQ8WYN0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATG4AQ8WYN0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATG4AQ8WYN0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATG4AQ8WYN0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATG4AQ8WYN0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATG4AQ8WYN0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATG4AQ8WYN0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATG4AQ8WYN0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATG4AQ8WYN0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATG4AQ8WYN0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATG4AQ8WYN0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ATG4AQ8WYN0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATG4AQ8WYN0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATG4AQ8WYN0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATG4AQ8WYN0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATG4AQ8WYN0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG4AQ8WYN0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG4AQ8WYN0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG4AQ8WYN0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG4AQ8WYN0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG4AQ8WYN0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG4AQ8WYN0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG4AQ8WYN0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG4AQ8WYN0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG4AQ8WYN0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATG4AQ8WYN0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATG4AQ8WYN0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATG4AQ8WYN0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATG4AQ8WYN0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG4AQ8WYN0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG4AQ8WYN0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG4AQ8WYN0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG4AQ8WYN0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG4AQ8WYN0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG4AQ8WYN0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATG4AQ8WYN0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ATG4AQ8WYN0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATG4AQ8WYN0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
ATG4AQ8WYN0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATG4AQ8WYN0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATG4AQ8WYN0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG4AQ8WYN0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG4AQ8WYN0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG4AQ8WYN0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG4AQ8WYN0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG4AQ8WYN0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG4AQ8WYN0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG4AQ8WYN0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG4AQ8WYN0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG4AQ8WYN0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG4AQ8WYN0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG4AQ8WYN0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG4AQ8WYN0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG4AQ8WYN0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG4AQ8WYN0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG4AQ8WYN0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG4AQ8WYN0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG4AQ8WYN0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG4AQ8WYN0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG4AQ8WYN0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG4AQ8WYN0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG4AQ8WYN0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG4AQ8WYN0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG4AQ8WYN0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG4AQ8WYN0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG4AQ8WYN0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG4AQ8WYN0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG4AQ8WYN0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG4AQ8WYN0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG4AQ8WYN0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG4AQ8WYN0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG4AQ8WYN0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG4AQ8WYN0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ATG4AQ8WYN0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATG4AQ8WYN0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATG4AQ8WYN0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATG4AQ8WYN0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATG4AQ8WYN0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATG4AQ8WYN0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG4AQ8WYN0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms