Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4B2

Irak3, Interleukin-1 receptor-associated kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irak3Q8K4B2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irak3Q8K4B2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irak3Q8K4B2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irak3Q8K4B2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irak3Q8K4B2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irak3Q8K4B2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irak3Q8K4B2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irak3Q8K4B2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irak3Q8K4B2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irak3Q8K4B2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irak3Q8K4B2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Irak3Q8K4B2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irak3Q8K4B2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Irak3Q8K4B2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irak3Q8K4B2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irak3Q8K4B2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irak3Q8K4B2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irak3Q8K4B2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irak3Q8K4B2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irak3Q8K4B2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irak3Q8K4B2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irak3Q8K4B2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irak3Q8K4B2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irak3Q8K4B2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irak3Q8K4B2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irak3Q8K4B2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irak3Q8K4B2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irak3Q8K4B2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irak3Q8K4B2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irak3Q8K4B2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irak3Q8K4B2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irak3Q8K4B2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irak3Q8K4B2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irak3Q8K4B2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irak3Q8K4B2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irak3Q8K4B2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irak3Q8K4B2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irak3Q8K4B2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irak3Q8K4B2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irak3Q8K4B2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irak3Q8K4B2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irak3Q8K4B2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irak3Q8K4B2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irak3Q8K4B2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irak3Q8K4B2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Irak3Q8K4B2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irak3Q8K4B2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irak3Q8K4B2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irak3Q8K4B2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irak3Q8K4B2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irak3Q8K4B2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irak3Q8K4B2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irak3Q8K4B2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irak3Q8K4B2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irak3Q8K4B2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irak3Q8K4B2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irak3Q8K4B2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irak3Q8K4B2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irak3Q8K4B2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irak3Q8K4B2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irak3Q8K4B2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irak3Q8K4B2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irak3Q8K4B2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irak3Q8K4B2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irak3Q8K4B2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irak3Q8K4B2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irak3Q8K4B2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irak3Q8K4B2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irak3Q8K4B2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irak3Q8K4B2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irak3Q8K4B2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irak3Q8K4B2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irak3Q8K4B2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irak3Q8K4B2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irak3Q8K4B2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irak3Q8K4B2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irak3Q8K4B2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irak3Q8K4B2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irak3Q8K4B2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irak3Q8K4B2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irak3Q8K4B2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irak3Q8K4B2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irak3Q8K4B2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irak3Q8K4B2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irak3Q8K4B2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irak3Q8K4B2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irak3Q8K4B2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irak3Q8K4B2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irak3Q8K4B2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Irak3Q8K4B2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irak3Q8K4B2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irak3Q8K4B2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irak3Q8K4B2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irak3Q8K4B2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irak3Q8K4B2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irak3Q8K4B2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irak3Q8K4B2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irak3Q8K4B2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irak3Q8K4B2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irak3Q8K4B2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms