Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU1

IGDCC3, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC3Q8IVU1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IGDCC3Q8IVU1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IGDCC3Q8IVU1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IGDCC3Q8IVU1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IGDCC3Q8IVU1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IGDCC3Q8IVU1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IGDCC3Q8IVU1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IGDCC3Q8IVU1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
IGDCC3Q8IVU1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IGDCC3Q8IVU1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IGDCC3Q8IVU1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IGDCC3Q8IVU1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IGDCC3Q8IVU1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IGDCC3Q8IVU1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IGDCC3Q8IVU1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IGDCC3Q8IVU1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IGDCC3Q8IVU1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IGDCC3Q8IVU1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IGDCC3Q8IVU1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IGDCC3Q8IVU1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IGDCC3Q8IVU1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IGDCC3Q8IVU1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IGDCC3Q8IVU1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IGDCC3Q8IVU1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IGDCC3Q8IVU1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IGDCC3Q8IVU1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IGDCC3Q8IVU1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IGDCC3Q8IVU1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IGDCC3Q8IVU1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IGDCC3Q8IVU1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
IGDCC3Q8IVU1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IGDCC3Q8IVU1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IGDCC3Q8IVU1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IGDCC3Q8IVU1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IGDCC3Q8IVU1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IGDCC3Q8IVU1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IGDCC3Q8IVU1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IGDCC3Q8IVU1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IGDCC3Q8IVU1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
IGDCC3Q8IVU1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
IGDCC3Q8IVU1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IGDCC3Q8IVU1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IGDCC3Q8IVU1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IGDCC3Q8IVU1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IGDCC3Q8IVU1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IGDCC3Q8IVU1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
IGDCC3Q8IVU1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
IGDCC3Q8IVU1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGDCC3Q8IVU1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
IGDCC3Q8IVU1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGDCC3Q8IVU1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGDCC3Q8IVU1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGDCC3Q8IVU1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGDCC3Q8IVU1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGDCC3Q8IVU1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
IGDCC3Q8IVU1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGDCC3Q8IVU1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGDCC3Q8IVU1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGDCC3Q8IVU1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGDCC3Q8IVU1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGDCC3Q8IVU1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGDCC3Q8IVU1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGDCC3Q8IVU1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGDCC3Q8IVU1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGDCC3Q8IVU1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
IGDCC3Q8IVU1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGDCC3Q8IVU1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGDCC3Q8IVU1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGDCC3Q8IVU1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGDCC3Q8IVU1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGDCC3Q8IVU1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IGDCC3Q8IVU1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IGDCC3Q8IVU1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
IGDCC3Q8IVU1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IGDCC3Q8IVU1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IGDCC3Q8IVU1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IGDCC3Q8IVU1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGDCC3Q8IVU1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGDCC3Q8IVU1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IGDCC3Q8IVU1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IGDCC3Q8IVU1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IGDCC3Q8IVU1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IGDCC3Q8IVU1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IGDCC3Q8IVU1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGDCC3Q8IVU1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGDCC3Q8IVU1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGDCC3Q8IVU1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGDCC3Q8IVU1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGDCC3Q8IVU1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGDCC3Q8IVU1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGDCC3Q8IVU1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGDCC3Q8IVU1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGDCC3Q8IVU1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGDCC3Q8IVU1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGDCC3Q8IVU1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGDCC3Q8IVU1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGDCC3Q8IVU1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGDCC3Q8IVU1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IGDCC3Q8IVU1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IGDCC3Q8IVU1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms