Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sgo2Q7TSY8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sgo2Q7TSY8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sgo2Q7TSY8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sgo2Q7TSY8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sgo2Q7TSY8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sgo2Q7TSY8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sgo2Q7TSY8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sgo2Q7TSY8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sgo2Q7TSY8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sgo2Q7TSY8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sgo2Q7TSY8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sgo2Q7TSY8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sgo2Q7TSY8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sgo2Q7TSY8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sgo2Q7TSY8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sgo2Q7TSY8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Sgo2Q7TSY8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sgo2Q7TSY8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Sgo2Q7TSY8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Sgo2Q7TSY8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sgo2Q7TSY8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sgo2Q7TSY8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sgo2Q7TSY8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sgo2Q7TSY8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sgo2Q7TSY8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sgo2Q7TSY8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sgo2Q7TSY8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sgo2Q7TSY8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sgo2Q7TSY8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sgo2Q7TSY8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sgo2Q7TSY8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sgo2Q7TSY8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sgo2Q7TSY8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sgo2Q7TSY8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sgo2Q7TSY8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sgo2Q7TSY8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sgo2Q7TSY8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sgo2Q7TSY8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sgo2Q7TSY8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sgo2Q7TSY8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sgo2Q7TSY8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sgo2Q7TSY8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sgo2Q7TSY8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sgo2Q7TSY8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sgo2Q7TSY8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sgo2Q7TSY8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sgo2Q7TSY8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sgo2Q7TSY8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sgo2Q7TSY8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sgo2Q7TSY8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sgo2Q7TSY8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sgo2Q7TSY8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sgo2Q7TSY8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sgo2Q7TSY8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sgo2Q7TSY8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sgo2Q7TSY8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sgo2Q7TSY8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sgo2Q7TSY8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sgo2Q7TSY8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sgo2Q7TSY8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Sgo2Q7TSY8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sgo2Q7TSY8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sgo2Q7TSY8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sgo2Q7TSY8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Sgo2Q7TSY8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sgo2Q7TSY8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sgo2Q7TSY8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sgo2Q7TSY8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sgo2Q7TSY8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sgo2Q7TSY8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sgo2Q7TSY8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sgo2Q7TSY8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sgo2Q7TSY8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sgo2Q7TSY8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sgo2Q7TSY8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sgo2Q7TSY8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sgo2Q7TSY8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sgo2Q7TSY8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sgo2Q7TSY8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sgo2Q7TSY8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sgo2Q7TSY8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sgo2Q7TSY8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sgo2Q7TSY8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sgo2Q7TSY8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sgo2Q7TSY8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sgo2Q7TSY8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sgo2Q7TSY8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sgo2Q7TSY8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sgo2Q7TSY8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sgo2Q7TSY8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sgo2Q7TSY8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sgo2Q7TSY8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sgo2Q7TSY8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sgo2Q7TSY8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Sgo2Q7TSY8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sgo2Q7TSY8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sgo2Q7TSY8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Sgo2Q7TSY8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sgo2Q7TSY8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms