Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atp8b3Q6UQ17 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atp8b3Q6UQ17 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atp8b3Q6UQ17 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Atp8b3Q6UQ17 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atp8b3Q6UQ17 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atp8b3Q6UQ17 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atp8b3Q6UQ17 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Atp8b3Q6UQ17 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Atp8b3Q6UQ17 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Atp8b3Q6UQ17 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Atp8b3Q6UQ17 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Atp8b3Q6UQ17 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atp8b3Q6UQ17 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atp8b3Q6UQ17 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atp8b3Q6UQ17 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atp8b3Q6UQ17 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atp8b3Q6UQ17 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atp8b3Q6UQ17 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atp8b3Q6UQ17 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atp8b3Q6UQ17 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atp8b3Q6UQ17 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atp8b3Q6UQ17 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atp8b3Q6UQ17 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atp8b3Q6UQ17 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atp8b3Q6UQ17 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atp8b3Q6UQ17 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atp8b3Q6UQ17 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atp8b3Q6UQ17 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atp8b3Q6UQ17 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Atp8b3Q6UQ17 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atp8b3Q6UQ17 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atp8b3Q6UQ17 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atp8b3Q6UQ17 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atp8b3Q6UQ17 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atp8b3Q6UQ17 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atp8b3Q6UQ17 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atp8b3Q6UQ17 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atp8b3Q6UQ17 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atp8b3Q6UQ17 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Atp8b3Q6UQ17 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atp8b3Q6UQ17 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atp8b3Q6UQ17 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atp8b3Q6UQ17 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atp8b3Q6UQ17 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atp8b3Q6UQ17 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atp8b3Q6UQ17 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atp8b3Q6UQ17 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atp8b3Q6UQ17 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atp8b3Q6UQ17 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atp8b3Q6UQ17 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atp8b3Q6UQ17 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atp8b3Q6UQ17 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atp8b3Q6UQ17 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atp8b3Q6UQ17 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Atp8b3Q6UQ17 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atp8b3Q6UQ17 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atp8b3Q6UQ17 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atp8b3Q6UQ17 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atp8b3Q6UQ17 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atp8b3Q6UQ17 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atp8b3Q6UQ17 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atp8b3Q6UQ17 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atp8b3Q6UQ17 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atp8b3Q6UQ17 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atp8b3Q6UQ17 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atp8b3Q6UQ17 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atp8b3Q6UQ17 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atp8b3Q6UQ17 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atp8b3Q6UQ17 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atp8b3Q6UQ17 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atp8b3Q6UQ17 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atp8b3Q6UQ17 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atp8b3Q6UQ17 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atp8b3Q6UQ17 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atp8b3Q6UQ17 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Atp8b3Q6UQ17 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atp8b3Q6UQ17 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atp8b3Q6UQ17 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atp8b3Q6UQ17 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atp8b3Q6UQ17 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atp8b3Q6UQ17 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atp8b3Q6UQ17 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atp8b3Q6UQ17 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atp8b3Q6UQ17 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atp8b3Q6UQ17 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Atp8b3Q6UQ17 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atp8b3Q6UQ17 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atp8b3Q6UQ17 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atp8b3Q6UQ17 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp8b3Q6UQ17 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp8b3Q6UQ17 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp8b3Q6UQ17 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp8b3Q6UQ17 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp8b3Q6UQ17 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp8b3Q6UQ17 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp8b3Q6UQ17 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atp8b3Q6UQ17 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atp8b3Q6UQ17 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atp8b3Q6UQ17 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
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