Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS9

Cacna2d2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d2Q6PHS9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cacna2d2Q6PHS9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cacna2d2Q6PHS9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cacna2d2Q6PHS9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cacna2d2Q6PHS9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacna2d2Q6PHS9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacna2d2Q6PHS9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacna2d2Q6PHS9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacna2d2Q6PHS9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacna2d2Q6PHS9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacna2d2Q6PHS9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacna2d2Q6PHS9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacna2d2Q6PHS9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacna2d2Q6PHS9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacna2d2Q6PHS9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacna2d2Q6PHS9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacna2d2Q6PHS9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacna2d2Q6PHS9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacna2d2Q6PHS9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacna2d2Q6PHS9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cacna2d2Q6PHS9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cacna2d2Q6PHS9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cacna2d2Q6PHS9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cacna2d2Q6PHS9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacna2d2Q6PHS9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacna2d2Q6PHS9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacna2d2Q6PHS9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacna2d2Q6PHS9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacna2d2Q6PHS9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacna2d2Q6PHS9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacna2d2Q6PHS9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacna2d2Q6PHS9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacna2d2Q6PHS9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacna2d2Q6PHS9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacna2d2Q6PHS9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacna2d2Q6PHS9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacna2d2Q6PHS9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacna2d2Q6PHS9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cacna2d2Q6PHS9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cacna2d2Q6PHS9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Cacna2d2Q6PHS9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cacna2d2Q6PHS9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cacna2d2Q6PHS9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacna2d2Q6PHS9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacna2d2Q6PHS9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacna2d2Q6PHS9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacna2d2Q6PHS9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacna2d2Q6PHS9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacna2d2Q6PHS9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacna2d2Q6PHS9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacna2d2Q6PHS9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacna2d2Q6PHS9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacna2d2Q6PHS9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacna2d2Q6PHS9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacna2d2Q6PHS9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacna2d2Q6PHS9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacna2d2Q6PHS9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacna2d2Q6PHS9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacna2d2Q6PHS9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacna2d2Q6PHS9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacna2d2Q6PHS9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacna2d2Q6PHS9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacna2d2Q6PHS9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacna2d2Q6PHS9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacna2d2Q6PHS9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacna2d2Q6PHS9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacna2d2Q6PHS9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacna2d2Q6PHS9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacna2d2Q6PHS9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacna2d2Q6PHS9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacna2d2Q6PHS9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacna2d2Q6PHS9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacna2d2Q6PHS9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacna2d2Q6PHS9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacna2d2Q6PHS9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacna2d2Q6PHS9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacna2d2Q6PHS9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacna2d2Q6PHS9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacna2d2Q6PHS9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacna2d2Q6PHS9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacna2d2Q6PHS9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacna2d2Q6PHS9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacna2d2Q6PHS9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacna2d2Q6PHS9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacna2d2Q6PHS9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacna2d2Q6PHS9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacna2d2Q6PHS9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacna2d2Q6PHS9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacna2d2Q6PHS9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacna2d2Q6PHS9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacna2d2Q6PHS9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna2d2Q6PHS9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna2d2Q6PHS9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna2d2Q6PHS9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna2d2Q6PHS9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna2d2Q6PHS9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacna2d2Q6PHS9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacna2d2Q6PHS9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacna2d2Q6PHS9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacna2d2Q6PHS9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms