Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHR2

ULK3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK3Q6PHR2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ULK3Q6PHR2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ULK3Q6PHR2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ULK3Q6PHR2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ULK3Q6PHR2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ULK3Q6PHR2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ULK3Q6PHR2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ULK3Q6PHR2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ULK3Q6PHR2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ULK3Q6PHR2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ULK3Q6PHR2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ULK3Q6PHR2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ULK3Q6PHR2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ULK3Q6PHR2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ULK3Q6PHR2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ULK3Q6PHR2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ULK3Q6PHR2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ULK3Q6PHR2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ULK3Q6PHR2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ULK3Q6PHR2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ULK3Q6PHR2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ULK3Q6PHR2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ULK3Q6PHR2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ULK3Q6PHR2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ULK3Q6PHR2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ULK3Q6PHR2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ULK3Q6PHR2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ULK3Q6PHR2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ULK3Q6PHR2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ULK3Q6PHR2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ULK3Q6PHR2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ULK3Q6PHR2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ULK3Q6PHR2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ULK3Q6PHR2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ULK3Q6PHR2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ULK3Q6PHR2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ULK3Q6PHR2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ULK3Q6PHR2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ULK3Q6PHR2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ULK3Q6PHR2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ULK3Q6PHR2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ULK3Q6PHR2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ULK3Q6PHR2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ULK3Q6PHR2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ULK3Q6PHR2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ULK3Q6PHR2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ULK3Q6PHR2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ULK3Q6PHR2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ULK3Q6PHR2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ULK3Q6PHR2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ULK3Q6PHR2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ULK3Q6PHR2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ULK3Q6PHR2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ULK3Q6PHR2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ULK3Q6PHR2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ULK3Q6PHR2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ULK3Q6PHR2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ULK3Q6PHR2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ULK3Q6PHR2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ULK3Q6PHR2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ULK3Q6PHR2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ULK3Q6PHR2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ULK3Q6PHR2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ULK3Q6PHR2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ULK3Q6PHR2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ULK3Q6PHR2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ULK3Q6PHR2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ULK3Q6PHR2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ULK3Q6PHR2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ULK3Q6PHR2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ULK3Q6PHR2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ULK3Q6PHR2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ULK3Q6PHR2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ULK3Q6PHR2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ULK3Q6PHR2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ULK3Q6PHR2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ULK3Q6PHR2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ULK3Q6PHR2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ULK3Q6PHR2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ULK3Q6PHR2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ULK3Q6PHR2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ULK3Q6PHR2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ULK3Q6PHR2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ULK3Q6PHR2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ULK3Q6PHR2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ULK3Q6PHR2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ULK3Q6PHR2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ULK3Q6PHR2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ULK3Q6PHR2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ULK3Q6PHR2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ULK3Q6PHR2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ULK3Q6PHR2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ULK3Q6PHR2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ULK3Q6PHR2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ULK3Q6PHR2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ULK3Q6PHR2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ULK3Q6PHR2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ULK3Q6PHR2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ULK3Q6PHR2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ULK3Q6PHR2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms