Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMBOX1Q6NT76 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMBOX1Q6NT76 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMBOX1Q6NT76 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMBOX1Q6NT76 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMBOX1Q6NT76 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMBOX1Q6NT76 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMBOX1Q6NT76 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMBOX1Q6NT76 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMBOX1Q6NT76 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMBOX1Q6NT76 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMBOX1Q6NT76 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMBOX1Q6NT76 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMBOX1Q6NT76 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMBOX1Q6NT76 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMBOX1Q6NT76 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMBOX1Q6NT76 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMBOX1Q6NT76 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMBOX1Q6NT76 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMBOX1Q6NT76 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMBOX1Q6NT76 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMBOX1Q6NT76 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMBOX1Q6NT76 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMBOX1Q6NT76 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMBOX1Q6NT76 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMBOX1Q6NT76 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMBOX1Q6NT76 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMBOX1Q6NT76 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMBOX1Q6NT76 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HMBOX1Q6NT76 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMBOX1Q6NT76 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMBOX1Q6NT76 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMBOX1Q6NT76 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMBOX1Q6NT76 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMBOX1Q6NT76 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMBOX1Q6NT76 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMBOX1Q6NT76 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HMBOX1Q6NT76 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMBOX1Q6NT76 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HMBOX1Q6NT76 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMBOX1Q6NT76 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMBOX1Q6NT76 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMBOX1Q6NT76 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMBOX1Q6NT76 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMBOX1Q6NT76 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMBOX1Q6NT76 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMBOX1Q6NT76 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMBOX1Q6NT76 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMBOX1Q6NT76 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMBOX1Q6NT76 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMBOX1Q6NT76 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HMBOX1Q6NT76 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMBOX1Q6NT76 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMBOX1Q6NT76 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMBOX1Q6NT76 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMBOX1Q6NT76 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMBOX1Q6NT76 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMBOX1Q6NT76 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMBOX1Q6NT76 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMBOX1Q6NT76 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HMBOX1Q6NT76 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMBOX1Q6NT76 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMBOX1Q6NT76 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMBOX1Q6NT76 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMBOX1Q6NT76 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMBOX1Q6NT76 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMBOX1Q6NT76 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMBOX1Q6NT76 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMBOX1Q6NT76 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMBOX1Q6NT76 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMBOX1Q6NT76 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMBOX1Q6NT76 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMBOX1Q6NT76 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMBOX1Q6NT76 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMBOX1Q6NT76 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMBOX1Q6NT76 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMBOX1Q6NT76 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMBOX1Q6NT76 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMBOX1Q6NT76 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMBOX1Q6NT76 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMBOX1Q6NT76 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMBOX1Q6NT76 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMBOX1Q6NT76 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMBOX1Q6NT76 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HMBOX1Q6NT76 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HMBOX1Q6NT76 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HMBOX1Q6NT76 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMBOX1Q6NT76 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMBOX1Q6NT76 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMBOX1Q6NT76 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMBOX1Q6NT76 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMBOX1Q6NT76 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMBOX1Q6NT76 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMBOX1Q6NT76 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMBOX1Q6NT76 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMBOX1Q6NT76 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMBOX1Q6NT76 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMBOX1Q6NT76 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMBOX1Q6NT76 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMBOX1Q6NT76 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms