Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATL3Q6DD88 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATL3Q6DD88 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATL3Q6DD88 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATL3Q6DD88 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ATL3Q6DD88 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATL3Q6DD88 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATL3Q6DD88 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATL3Q6DD88 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATL3Q6DD88 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATL3Q6DD88 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATL3Q6DD88 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ATL3Q6DD88 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ATL3Q6DD88 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATL3Q6DD88 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ATL3Q6DD88 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATL3Q6DD88 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ATL3Q6DD88 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATL3Q6DD88 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATL3Q6DD88 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ATL3Q6DD88 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ATL3Q6DD88 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATL3Q6DD88 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATL3Q6DD88 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATL3Q6DD88 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATL3Q6DD88 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATL3Q6DD88 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATL3Q6DD88 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATL3Q6DD88 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATL3Q6DD88 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATL3Q6DD88 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ATL3Q6DD88 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATL3Q6DD88 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATL3Q6DD88 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATL3Q6DD88 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATL3Q6DD88 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATL3Q6DD88 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATL3Q6DD88 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATL3Q6DD88 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATL3Q6DD88 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATL3Q6DD88 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATL3Q6DD88 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATL3Q6DD88 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATL3Q6DD88 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATL3Q6DD88 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATL3Q6DD88 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATL3Q6DD88 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATL3Q6DD88 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATL3Q6DD88 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATL3Q6DD88 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATL3Q6DD88 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATL3Q6DD88 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATL3Q6DD88 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATL3Q6DD88 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATL3Q6DD88 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATL3Q6DD88 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATL3Q6DD88 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATL3Q6DD88 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATL3Q6DD88 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATL3Q6DD88 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ATL3Q6DD88 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATL3Q6DD88 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATL3Q6DD88 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATL3Q6DD88 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATL3Q6DD88 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATL3Q6DD88 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ATL3Q6DD88 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATL3Q6DD88 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATL3Q6DD88 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATL3Q6DD88 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATL3Q6DD88 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATL3Q6DD88 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATL3Q6DD88 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATL3Q6DD88 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATL3Q6DD88 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATL3Q6DD88 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATL3Q6DD88 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATL3Q6DD88 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATL3Q6DD88 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATL3Q6DD88 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATL3Q6DD88 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATL3Q6DD88 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATL3Q6DD88 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATL3Q6DD88 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATL3Q6DD88 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATL3Q6DD88 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATL3Q6DD88 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATL3Q6DD88 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATL3Q6DD88 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ATL3Q6DD88 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ATL3Q6DD88 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATL3Q6DD88 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATL3Q6DD88 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATL3Q6DD88 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATL3Q6DD88 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATL3Q6DD88 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATL3Q6DD88 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATL3Q6DD88 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATL3Q6DD88 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATL3Q6DD88 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms