Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW5

Rnf10, RING finger protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf10Q3UIW5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf10Q3UIW5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf10Q3UIW5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf10Q3UIW5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf10Q3UIW5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf10Q3UIW5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf10Q3UIW5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf10Q3UIW5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf10Q3UIW5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf10Q3UIW5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf10Q3UIW5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf10Q3UIW5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf10Q3UIW5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf10Q3UIW5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf10Q3UIW5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf10Q3UIW5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf10Q3UIW5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf10Q3UIW5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf10Q3UIW5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf10Q3UIW5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf10Q3UIW5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf10Q3UIW5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf10Q3UIW5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf10Q3UIW5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf10Q3UIW5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf10Q3UIW5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf10Q3UIW5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf10Q3UIW5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf10Q3UIW5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf10Q3UIW5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf10Q3UIW5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf10Q3UIW5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf10Q3UIW5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf10Q3UIW5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf10Q3UIW5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf10Q3UIW5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf10Q3UIW5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf10Q3UIW5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf10Q3UIW5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf10Q3UIW5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf10Q3UIW5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf10Q3UIW5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf10Q3UIW5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf10Q3UIW5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf10Q3UIW5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf10Q3UIW5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf10Q3UIW5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf10Q3UIW5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf10Q3UIW5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf10Q3UIW5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf10Q3UIW5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf10Q3UIW5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf10Q3UIW5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf10Q3UIW5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf10Q3UIW5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf10Q3UIW5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf10Q3UIW5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf10Q3UIW5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf10Q3UIW5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf10Q3UIW5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf10Q3UIW5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf10Q3UIW5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf10Q3UIW5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf10Q3UIW5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf10Q3UIW5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf10Q3UIW5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf10Q3UIW5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf10Q3UIW5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf10Q3UIW5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf10Q3UIW5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf10Q3UIW5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf10Q3UIW5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf10Q3UIW5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf10Q3UIW5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf10Q3UIW5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf10Q3UIW5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf10Q3UIW5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf10Q3UIW5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf10Q3UIW5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf10Q3UIW5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf10Q3UIW5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf10Q3UIW5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf10Q3UIW5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf10Q3UIW5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf10Q3UIW5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf10Q3UIW5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf10Q3UIW5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf10Q3UIW5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf10Q3UIW5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf10Q3UIW5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf10Q3UIW5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf10Q3UIW5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf10Q3UIW5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf10Q3UIW5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf10Q3UIW5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf10Q3UIW5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf10Q3UIW5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf10Q3UIW5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf10Q3UIW5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf10Q3UIW5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms