Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 YOX1YML027W 1158 nt7.49□□□□□ -1.21
LSP1Q12230 GEF1YJR040W 2340 nt7.49□□□□□ -1.21
LSP1Q12230 DAL4YIR028W 1908 nt7.48□□□□□ -1.21
LSP1Q12230 QCR6YFR033C 444 nt7.48□□□□□ -1.21
LSP1Q12230 RUF23RUF23 254 nt7.48□□□□□ -1.21
LSP1Q12230 RAP1YNL216W 2484 nt7.47□□□□□ -1.21
LSP1Q12230 TKL2YBR117C 2046 nt7.47□□□□□ -1.21
LSP1Q12230 MDE1YJR024C 735 nt7.47□□□□□ -1.21
LSP1Q12230 RNH1YMR234W 1047 nt7.47□□□□□ -1.21
LSP1Q12230 ZIM17YNL310C 525 nt7.47□□□□□ -1.21
LSP1Q12230 MET8YBR213W 825 nt7.47□□□□□ -1.21
LSP1Q12230 RIO1YOR119C 1455 nt7.47□□□□□ -1.21
LSP1Q12230 COX9YDL067C 180 nt7.46□□□□□ -1.22
LSP1Q12230 LYS1YIR034C 1122 nt7.46□□□□□ -1.22
LSP1Q12230 ICT1YLR099C 1185 nt7.46□□□□□ -1.22
LSP1Q12230 IES2YNL215W 963 nt7.46□□□□□ -1.22
LSP1Q12230 ASR1YPR093C 867 nt7.46□□□□□ -1.22
LSP1Q12230 YEN1YER041W 2280 nt7.46□□□□□ -1.22
LSP1Q12230 YML6YML025C 861 nt7.45□□□□□ -1.22
LSP1Q12230 MRPL1YDR116C 858 nt7.43□□□□□ -1.22
LSP1Q12230 KTR1YOR099W 1182 nt7.43□□□□□ -1.22
LSP1Q12230 LAT1YNL071W 1449 nt7.43□□□□□ -1.22
LSP1Q12230 VMA3YEL027W 483 nt7.42□□□□□ -1.22
LSP1Q12230 PFK2YMR205C 2880 nt7.42□□□□□ -1.22
LSP1Q12230 YGR054WYGR054W 1929 nt7.42□□□□□ -1.22
LSP1Q12230 LCB3YJL134W 1230 nt7.41□□□□□ -1.22
LSP1Q12230 ARA2YMR041C 1008 nt7.41□□□□□ -1.22
LSP1Q12230 YML133CYML133C 4125 nt7.41□□□□□ -1.22
LSP1Q12230 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt7.4□□□□□ -1.22
LSP1Q12230 EFM3YJR129C 1020 nt7.4□□□□□ -1.22
LSP1Q12230 RPL21AYBR191W 483 nt7.4□□□□□ -1.22
LSP1Q12230 MRC1YCL061C 3291 nt7.4□□□□□ -1.23
LSP1Q12230 FMP40YPL222W 2067 nt7.39□□□□□ -1.23
LSP1Q12230 ARE2YNR019W 1929 nt7.39□□□□□ -1.23
LSP1Q12230 YHL017WYHL017W 1599 nt7.39□□□□□ -1.23
LSP1Q12230 TMT1YER175C 900 nt7.39□□□□□ -1.23
LSP1Q12230 POP5YAL033W 522 nt7.39□□□□□ -1.23
LSP1Q12230 MEH1YKR007W 555 nt7.39□□□□□ -1.23
LSP1Q12230 RPR1RPR1 369 nt7.39□□□□□ -1.23
LSP1Q12230 LGE1YPL055C 999 nt7.38□□□□□ -1.23
LSP1Q12230 ECM31YBR176W 939 nt7.38□□□□□ -1.23
LSP1Q12230 FET4YMR319C 1659 nt7.38□□□□□ -1.23
LSP1Q12230 PRE5YMR314W 705 nt7.37□□□□□ -1.23
LSP1Q12230 LSC1YOR142W 990 nt7.37□□□□□ -1.23
LSP1Q12230 STB5YHR178W 2232 nt7.37□□□□□ -1.23
LSP1Q12230 CCT8YJL008C 1707 nt7.37□□□□□ -1.23
LSP1Q12230 CRH1YGR189C 1524 nt7.37□□□□□ -1.23
LSP1Q12230 YDR514CYDR514C 1452 nt7.36□□□□□ -1.23
LSP1Q12230 YDR278CYDR278C 318 nt7.36□□□□□ -1.23
LSP1Q12230 YGL235WYGL235W 537 nt7.36□□□□□ -1.23
LSP1Q12230 ERP2YAL007C 648 nt7.36□□□□□ -1.23
LSP1Q12230 CTF19YPL018W 1110 nt7.36□□□□□ -1.23
LSP1Q12230 PPT1YGR123C 1542 nt7.36□□□□□ -1.23
LSP1Q12230 YIL055CYIL055C 1884 nt7.35□□□□□ -1.23
LSP1Q12230 LDB7YBL006C 543 nt7.35□□□□□ -1.23
LSP1Q12230 YML083CYML083C 1257 nt7.35□□□□□ -1.23
LSP1Q12230 SPE3YPR069C 882 nt7.35□□□□□ -1.23
LSP1Q12230 COX15YER141W 1461 nt7.35□□□□□ -1.23
LSP1Q12230 PRP24YMR268C 1335 nt7.33□□□□□ -1.24
LSP1Q12230 YPR123CYPR123C 435 nt7.33□□□□□ -1.24
LSP1Q12230 PYK2YOR347C 1521 nt7.32□□□□□ -1.24
LSP1Q12230 HOC1YJR075W 1191 nt7.32□□□□□ -1.24
LSP1Q12230 SRL2YLR082C 1179 nt7.32□□□□□ -1.24
LSP1Q12230 MCP1YOR228C 909 nt7.32□□□□□ -1.24
LSP1Q12230 HXT2YMR011W 1626 nt7.31□□□□□ -1.24
LSP1Q12230 MRPL35YDR322W 1104 nt7.31□□□□□ -1.24
LSP1Q12230 OAC1YKL120W 975 nt7.31□□□□□ -1.24
LSP1Q12230 GTO3YMR251W 1101 nt7.31□□□□□ -1.24
LSP1Q12230 BIO3YNR058W 1443 nt7.31□□□□□ -1.24
LSP1Q12230 YMC1YPR058W 924 nt7.31□□□□□ -1.24
LSP1Q12230 PTC4YBR125C 1182 nt7.31□□□□□ -1.24
LSP1Q12230 YTP1YNL237W 1380 nt7.31□□□□□ -1.24
LSP1Q12230 RGD1YBR260C 2001 nt7.3□□□□□ -1.24
LSP1Q12230 EXG1YLR300W 1347 nt7.3□□□□□ -1.24
LSP1Q12230 LIA1YJR070C 978 nt7.3□□□□□ -1.24
LSP1Q12230 MSO1YNR049C 633 nt7.3□□□□□ -1.24
LSP1Q12230 PET112YBL080C 1626 nt7.3□□□□□ -1.24
LSP1Q12230 PGK1YCR012W 1251 nt7.29□□□□□ -1.24
LSP1Q12230 ASF1YJL115W 840 nt7.29□□□□□ -1.24
LSP1Q12230 AMD2YDR242W 1650 nt7.28□□□□□ -1.24
LSP1Q12230 PTC3YBL056W 1407 nt7.28□□□□□ -1.24
LSP1Q12230 YOL036WYOL036W 2286 nt7.28□□□□□ -1.24
LSP1Q12230 LCL3YGL085W 825 nt7.28□□□□□ -1.24
LSP1Q12230 YOL163WYOL163W 510 nt7.28□□□□□ -1.24
LSP1Q12230 GPD1YDL022W 1176 nt7.27□□□□□ -1.25
LSP1Q12230 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt7.27□□□□□ -1.25
LSP1Q12230 RIX7YLL034C 2514 nt7.27□□□□□ -1.25
LSP1Q12230 ILV1YER086W 1731 nt7.27□□□□□ -1.25
LSP1Q12230 AFG1YEL052W 1530 nt7.27□□□□□ -1.25
LSP1Q12230 GPA1YHR005C 1419 nt7.27□□□□□ -1.25
LSP1Q12230 FMO1YHR176W 1299 nt7.26□□□□□ -1.25
LSP1Q12230 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt7.26□□□□□ -1.25
LSP1Q12230 RPS28AYOR167C 204 nt7.26□□□□□ -1.25
LSP1Q12230 GLN1YPR035W 1113 nt7.26□□□□□ -1.25
LSP1Q12230 CNE1YAL058W 1509 nt7.26□□□□□ -1.25
LSP1Q12230 TEP1YNL128W 1305 nt7.26□□□□□ -1.25
LSP1Q12230 GPD2YOL059W 1323 nt7.26□□□□□ -1.25
LSP1Q12230 VPS4YPR173C 1314 nt7.26□□□□□ -1.25
LSP1Q12230 FRE5YOR384W 2085 nt7.25□□□□□ -1.25
LSP1Q12230 MRS1YIR021W 1092 nt7.25□□□□□ -1.25
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