Protein–RNA interactions for Protein: Q06149

PDR8, Transcription factor PDR8, yeastyeast

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDR8Q06149 YHR020WYHR020W 2067 nt6.3□□□□□ -1.4
PDR8Q06149 HXT2YMR011W 1626 nt6.3□□□□□ -1.4
PDR8Q06149 FZF1YGL254W 900 nt6.3□□□□□ -1.4
PDR8Q06149 RNH1YMR234W 1047 nt6.3□□□□□ -1.4
PDR8Q06149 HMT1YBR034C 1047 nt6.3□□□□□ -1.4
PDR8Q06149 RGD2YFL047W 2145 nt6.29□□□□□ -1.4
PDR8Q06149 NPL6YMR091C 1308 nt6.29□□□□□ -1.4
PDR8Q06149 SHO1YER118C 1104 nt6.29□□□□□ -1.4
PDR8Q06149 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt6.29□□□□□ -1.4
PDR8Q06149 YKL102CYKL102C 306 nt6.29□□□□□ -1.4
PDR8Q06149 TAF9YMR236W 474 nt6.29□□□□□ -1.4
PDR8Q06149 MRPS18YNL306W 654 nt6.29□□□□□ -1.4
PDR8Q06149 COQ1YBR003W 1422 nt6.29□□□□□ -1.4
PDR8Q06149 ATF1YOR377W 1578 nt6.29□□□□□ -1.4
PDR8Q06149 CYC8YBR112C 2901 nt6.29□□□□□ -1.4
PDR8Q06149 HXK2YGL253W 1461 nt6.28□□□□□ -1.4
PDR8Q06149 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt6.28□□□□□ -1.4
PDR8Q06149 YNL092WYNL092W 1203 nt6.28□□□□□ -1.4
PDR8Q06149 ATP4YPL078C 735 nt6.28□□□□□ -1.4
PDR8Q06149 YBR226CYBR226C 411 nt6.28□□□□□ -1.4
PDR8Q06149 SAL1YNL083W 1485 nt6.28□□□□□ -1.4
PDR8Q06149 MIP1YOR330C 3765 nt6.28□□□□□ -1.4
PDR8Q06149 RAP1YNL216W 2484 nt6.27□□□□□ -1.4
PDR8Q06149 PPM2YOL141W 2088 nt6.27□□□□□ -1.41
PDR8Q06149 YUR1YJL139C 1287 nt6.27□□□□□ -1.41
PDR8Q06149 IRC11YOR013W 471 nt6.27□□□□□ -1.41
PDR8Q06149 HIS7YBR248C 1659 nt6.26□□□□□ -1.41
PDR8Q06149 COX16YJL003W 357 nt6.26□□□□□ -1.41
PDR8Q06149 MRPL23YOR150W 492 nt6.26□□□□□ -1.41
PDR8Q06149 GCG1YER163C 699 nt6.25□□□□□ -1.41
PDR8Q06149 ILV6YCL009C 930 nt6.25□□□□□ -1.41
PDR8Q06149 COX10YPL172C 1389 nt6.25□□□□□ -1.41
PDR8Q06149 HXT17YNR072W 1695 nt6.25□□□□□ -1.41
PDR8Q06149 ALT2YDR111C 1524 nt6.25□□□□□ -1.41
PDR8Q06149 STT3YGL022W 2157 nt6.24□□□□□ -1.41
PDR8Q06149 YPR204WYPR204W 3099 nt6.24□□□□□ -1.41
PDR8Q06149 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt6.24□□□□□ -1.41
PDR8Q06149 SUF16tG(GCC)C 71 nt6.24□□□□□ -1.41
PDR8Q06149 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt6.24□□□□□ -1.41
PDR8Q06149 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt6.24□□□□□ -1.41
PDR8Q06149 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt6.24□□□□□ -1.41
PDR8Q06149 SUF20tG(GCC)F1 71 nt6.24□□□□□ -1.41
PDR8Q06149 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt6.24□□□□□ -1.41
PDR8Q06149 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt6.24□□□□□ -1.41
PDR8Q06149 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt6.24□□□□□ -1.41
PDR8Q06149 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt6.24□□□□□ -1.41
PDR8Q06149 SUF23tG(GCC)J2 71 nt6.24□□□□□ -1.41
PDR8Q06149 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt6.24□□□□□ -1.41
PDR8Q06149 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt6.24□□□□□ -1.41
PDR8Q06149 SUF17tG(GCC)O2 71 nt6.24□□□□□ -1.41
PDR8Q06149 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt6.24□□□□□ -1.41
PDR8Q06149 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt6.24□□□□□ -1.41
PDR8Q06149 YRB2YIL063C 984 nt6.24□□□□□ -1.41
PDR8Q06149 AIM20YIL158W 615 nt6.24□□□□□ -1.41
PDR8Q06149 YHK8YHR048W 1545 nt6.24□□□□□ -1.41
PDR8Q06149 RIO1YOR119C 1455 nt6.23□□□□□ -1.41
PDR8Q06149 PPH22YDL188C 1134 nt6.23□□□□□ -1.41
PDR8Q06149 PMP3YDR276C 168 nt6.23□□□□□ -1.41
PDR8Q06149 ATG36YJL185C 882 nt6.23□□□□□ -1.41
PDR8Q06149 YNL017CYNL017C 339 nt6.23□□□□□ -1.41
PDR8Q06149 POP1YNL221C 2628 nt6.23□□□□□ -1.41
PDR8Q06149 PXL1YKR090W 2121 nt6.22□□□□□ -1.41
PDR8Q06149 OM45YIL136W 1182 nt6.22□□□□□ -1.41
PDR8Q06149 GCN3YKR026C 918 nt6.22□□□□□ -1.41
PDR8Q06149 ARG81YML099C 2643 nt6.22□□□□□ -1.41
PDR8Q06149 NSE5YML023C 1671 nt6.21□□□□□ -1.42
PDR8Q06149 IMG1YCR046C 510 nt6.21□□□□□ -1.42
PDR8Q06149 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt6.21□□□□□ -1.42
PDR8Q06149 YKL153WYKL153W 510 nt6.21□□□□□ -1.42
PDR8Q06149 SRY1YKL218C 981 nt6.21□□□□□ -1.42
PDR8Q06149 YAR064WYAR064W 300 nt6.21□□□□□ -1.42
PDR8Q06149 CUE4YML101C 354 nt6.21□□□□□ -1.42
PDR8Q06149 DFR1YOR236W 636 nt6.21□□□□□ -1.42
PDR8Q06149 RPL5YPL131W 894 nt6.21□□□□□ -1.42
PDR8Q06149 RFC4YOL094C 972 nt6.2□□□□□ -1.42
PDR8Q06149 EFT2YDR385W 2529 nt6.2□□□□□ -1.42
PDR8Q06149 CDC16YKL022C 2523 nt6.2□□□□□ -1.42
PDR8Q06149 EFT1YOR133W 2529 nt6.2□□□□□ -1.42
PDR8Q06149 SNU71YGR013W 1863 nt6.19□□□□□ -1.42
PDR8Q06149 YIL055CYIL055C 1884 nt6.19□□□□□ -1.42
PDR8Q06149 PEX31YGR004W 1389 nt6.19□□□□□ -1.42
PDR8Q06149 RIX7YLL034C 2514 nt6.19□□□□□ -1.42
PDR8Q06149 HIS1YER055C 894 nt6.19□□□□□ -1.42
PDR8Q06149 RRP46YGR095C 672 nt6.19□□□□□ -1.42
PDR8Q06149 MHT1YLL062C 975 nt6.19□□□□□ -1.42
PDR8Q06149 SCS22YBL091C-A 528 nt6.19□□□□□ -1.42
PDR8Q06149 YPL257WYPL257W 582 nt6.19□□□□□ -1.42
PDR8Q06149 GEF1YJR040W 2340 nt6.19□□□□□ -1.42
PDR8Q06149 ERG8YMR220W 1356 nt6.18□□□□□ -1.42
PDR8Q06149 GDA1YEL042W 1557 nt6.18□□□□□ -1.42
PDR8Q06149 CSC1YLR241W 2349 nt6.18□□□□□ -1.42
PDR8Q06149 YHR145CYHR145C 357 nt6.18□□□□□ -1.42
PDR8Q06149 MIA40YKL195W 1212 nt6.18□□□□□ -1.42
PDR8Q06149 DID2YKR035W-A 615 nt6.18□□□□□ -1.42
PDR8Q06149 TSR2YLR435W 618 nt6.18□□□□□ -1.42
PDR8Q06149 FAL1YDR021W 1200 nt6.17□□□□□ -1.42
PDR8Q06149 BUR6YER159C 429 nt6.17□□□□□ -1.42
PDR8Q06149 YGR127WYGR127W 939 nt6.17□□□□□ -1.42
PDR8Q06149 YJR146WYJR146W 354 nt6.17□□□□□ -1.42
PDR8Q06149 YKR045CYKR045C 552 nt6.17□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 46.1 ms