Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCT3P49368 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCT3P49368 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCT3P49368 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCT3P49368 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCT3P49368 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCT3P49368 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCT3P49368 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCT3P49368 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCT3P49368 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCT3P49368 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCT3P49368 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCT3P49368 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCT3P49368 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCT3P49368 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCT3P49368 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCT3P49368 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCT3P49368 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCT3P49368 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCT3P49368 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCT3P49368 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCT3P49368 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCT3P49368 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCT3P49368 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCT3P49368 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCT3P49368 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCT3P49368 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCT3P49368 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCT3P49368 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCT3P49368 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCT3P49368 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCT3P49368 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCT3P49368 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCT3P49368 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCT3P49368 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCT3P49368 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCT3P49368 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCT3P49368 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCT3P49368 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCT3P49368 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCT3P49368 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCT3P49368 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT3P49368 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT3P49368 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT3P49368 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCT3P49368 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCT3P49368 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCT3P49368 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCT3P49368 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCT3P49368 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCT3P49368 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT3P49368 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT3P49368 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT3P49368 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT3P49368 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT3P49368 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT3P49368 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT3P49368 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT3P49368 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT3P49368 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT3P49368 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT3P49368 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT3P49368 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT3P49368 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT3P49368 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT3P49368 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT3P49368 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT3P49368 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT3P49368 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT3P49368 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT3P49368 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT3P49368 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT3P49368 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT3P49368 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT3P49368 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT3P49368 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT3P49368 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT3P49368 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT3P49368 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT3P49368 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT3P49368 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT3P49368 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT3P49368 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT3P49368 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT3P49368 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT3P49368 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT3P49368 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT3P49368 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT3P49368 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT3P49368 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT3P49368 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT3P49368 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT3P49368 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT3P49368 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT3P49368 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT3P49368 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT3P49368 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT3P49368 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT3P49368 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT3P49368 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms