Protein–RNA interactions for Protein: P39876

Timp3, Metalloproteinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp3P39876 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Timp3P39876 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Timp3P39876 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Timp3P39876 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Timp3P39876 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Timp3P39876 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Timp3P39876 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Timp3P39876 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Timp3P39876 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Timp3P39876 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Timp3P39876 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Timp3P39876 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Timp3P39876 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Timp3P39876 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Timp3P39876 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Timp3P39876 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Timp3P39876 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Timp3P39876 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Timp3P39876 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Timp3P39876 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Timp3P39876 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Timp3P39876 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Timp3P39876 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Timp3P39876 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Timp3P39876 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Timp3P39876 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Timp3P39876 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Timp3P39876 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Timp3P39876 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Timp3P39876 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Timp3P39876 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Timp3P39876 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Timp3P39876 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Timp3P39876 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Timp3P39876 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Timp3P39876 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Timp3P39876 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Timp3P39876 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Timp3P39876 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Timp3P39876 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Timp3P39876 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Timp3P39876 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Timp3P39876 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Timp3P39876 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Timp3P39876 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Timp3P39876 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Timp3P39876 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Timp3P39876 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Timp3P39876 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Timp3P39876 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Timp3P39876 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Timp3P39876 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Timp3P39876 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Timp3P39876 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Timp3P39876 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Timp3P39876 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Timp3P39876 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Timp3P39876 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Timp3P39876 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Timp3P39876 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Timp3P39876 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Timp3P39876 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Timp3P39876 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Timp3P39876 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Timp3P39876 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Timp3P39876 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Timp3P39876 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Timp3P39876 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Timp3P39876 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Timp3P39876 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Timp3P39876 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Timp3P39876 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Timp3P39876 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Timp3P39876 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Timp3P39876 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Timp3P39876 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Timp3P39876 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Timp3P39876 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Timp3P39876 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Timp3P39876 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Timp3P39876 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Timp3P39876 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Timp3P39876 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Timp3P39876 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Timp3P39876 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Timp3P39876 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Timp3P39876 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Timp3P39876 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Timp3P39876 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Timp3P39876 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Timp3P39876 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Timp3P39876 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Timp3P39876 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Timp3P39876 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Timp3P39876 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Timp3P39876 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Timp3P39876 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Timp3P39876 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Timp3P39876 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Timp3P39876 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms