Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL4P36578 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL4P36578 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL4P36578 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL4P36578 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL4P36578 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL4P36578 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL4P36578 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL4P36578 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL4P36578 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL4P36578 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL4P36578 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL4P36578 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL4P36578 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL4P36578 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL4P36578 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RPL4P36578 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL4P36578 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL4P36578 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL4P36578 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL4P36578 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL4P36578 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL4P36578 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL4P36578 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL4P36578 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL4P36578 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL4P36578 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL4P36578 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL4P36578 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL4P36578 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL4P36578 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL4P36578 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL4P36578 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL4P36578 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL4P36578 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL4P36578 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL4P36578 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL4P36578 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL4P36578 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL4P36578 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL4P36578 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL4P36578 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL4P36578 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL4P36578 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL4P36578 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL4P36578 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL4P36578 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL4P36578 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL4P36578 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL4P36578 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL4P36578 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL4P36578 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL4P36578 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL4P36578 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL4P36578 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL4P36578 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL4P36578 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL4P36578 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL4P36578 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL4P36578 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL4P36578 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL4P36578 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL4P36578 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL4P36578 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL4P36578 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL4P36578 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL4P36578 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL4P36578 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL4P36578 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL4P36578 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL4P36578 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL4P36578 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL4P36578 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL4P36578 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL4P36578 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL4P36578 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL4P36578 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL4P36578 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL4P36578 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL4P36578 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL4P36578 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL4P36578 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL4P36578 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL4P36578 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL4P36578 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL4P36578 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL4P36578 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL4P36578 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPL4P36578 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL4P36578 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL4P36578 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL4P36578 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL4P36578 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL4P36578 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL4P36578 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL4P36578 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL4P36578 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL4P36578 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL4P36578 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL4P36578 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms