Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RxrgP28705 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RxrgP28705 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RxrgP28705 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RxrgP28705 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RxrgP28705 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RxrgP28705 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RxrgP28705 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RxrgP28705 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RxrgP28705 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RxrgP28705 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RxrgP28705 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RxrgP28705 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RxrgP28705 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RxrgP28705 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RxrgP28705 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RxrgP28705 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RxrgP28705 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RxrgP28705 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RxrgP28705 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RxrgP28705 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RxrgP28705 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RxrgP28705 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RxrgP28705 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RxrgP28705 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RxrgP28705 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RxrgP28705 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RxrgP28705 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RxrgP28705 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RxrgP28705 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RxrgP28705 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RxrgP28705 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RxrgP28705 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RxrgP28705 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RxrgP28705 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RxrgP28705 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RxrgP28705 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RxrgP28705 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RxrgP28705 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RxrgP28705 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RxrgP28705 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RxrgP28705 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RxrgP28705 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RxrgP28705 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RxrgP28705 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RxrgP28705 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RxrgP28705 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RxrgP28705 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RxrgP28705 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RxrgP28705 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RxrgP28705 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RxrgP28705 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RxrgP28705 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RxrgP28705 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RxrgP28705 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RxrgP28705 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RxrgP28705 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RxrgP28705 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RxrgP28705 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RxrgP28705 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RxrgP28705 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RxrgP28705 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RxrgP28705 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RxrgP28705 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RxrgP28705 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RxrgP28705 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RxrgP28705 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RxrgP28705 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RxrgP28705 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RxrgP28705 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RxrgP28705 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RxrgP28705 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RxrgP28705 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RxrgP28705 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RxrgP28705 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RxrgP28705 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RxrgP28705 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RxrgP28705 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RxrgP28705 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RxrgP28705 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RxrgP28705 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RxrgP28705 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RxrgP28705 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RxrgP28705 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RxrgP28705 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RxrgP28705 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RxrgP28705 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RxrgP28705 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RxrgP28705 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RxrgP28705 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RxrgP28705 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RxrgP28705 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RxrgP28705 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RxrgP28705 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RxrgP28705 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RxrgP28705 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RxrgP28705 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RxrgP28705 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RxrgP28705 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RxrgP28705 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms