Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X1B8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X1B8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A087X1B8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A087X1B8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A087X1B8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A087X1B8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A087X1B8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A087X1B8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A087X1B8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A087X1B8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A087X1B8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
A0A087X1B8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A087X1B8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A087X1B8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A087X1B8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A087X1B8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A087X1B8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A087X1B8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A087X1B8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A087X1B8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A087X1B8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A087X1B8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A087X1B8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A087X1B8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A087X1B8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A087X1B8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A087X1B8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A087X1B8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A087X1B8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A087X1B8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A087X1B8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A087X1B8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A087X1B8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A087X1B8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A087X1B8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A087X1B8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A087X1B8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A087X1B8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A087X1B8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A087X1B8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A087X1B8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A087X1B8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A087X1B8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A087X1B8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
A0A087X1B8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24■■□□□ 1.43
A0A087X1B8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24■■□□□ 1.43
A0A087X1B8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A087X1B8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A087X1B8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A087X1B8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A087X1B8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A087X1B8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A087X1B8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A087X1B8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A087X1B8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A087X1B8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A087X1B8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A087X1B8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A087X1B8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A087X1B8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A087X1B8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A087X1B8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A087X1B8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A087X1B8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A087X1B8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A087X1B8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A087X1B8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
A0A087X1B8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
A0A087X1B8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
A0A087X1B8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A087X1B8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A087X1B8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A087X1B8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A087X1B8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A087X1B8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A087X1B8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A087X1B8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A087X1B8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A087X1B8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A087X1B8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A087X1B8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A087X1B8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A087X1B8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A087X1B8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A087X1B8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A087X1B8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A087X1B8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A087X1B8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A087X1B8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A087X1B8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A087X1B8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A087X1B8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A087X1B8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A087X1B8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A087X1B8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A087X1B8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A087X1B8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A087X1B8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A087X1B8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A087X1B8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A087X1B8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms