Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WP46

BC034090, cDNA sequence BC034090, mousemouse

Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC034090A0A087WP46 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BC034090A0A087WP46 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BC034090A0A087WP46 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BC034090A0A087WP46 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BC034090A0A087WP46 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BC034090A0A087WP46 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BC034090A0A087WP46 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BC034090A0A087WP46 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BC034090A0A087WP46 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BC034090A0A087WP46 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BC034090A0A087WP46 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BC034090A0A087WP46 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BC034090A0A087WP46 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BC034090A0A087WP46 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BC034090A0A087WP46 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BC034090A0A087WP46 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BC034090A0A087WP46 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BC034090A0A087WP46 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BC034090A0A087WP46 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BC034090A0A087WP46 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BC034090A0A087WP46 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
BC034090A0A087WP46 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BC034090A0A087WP46 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BC034090A0A087WP46 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BC034090A0A087WP46 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BC034090A0A087WP46 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BC034090A0A087WP46 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BC034090A0A087WP46 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BC034090A0A087WP46 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BC034090A0A087WP46 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BC034090A0A087WP46 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BC034090A0A087WP46 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BC034090A0A087WP46 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BC034090A0A087WP46 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BC034090A0A087WP46 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BC034090A0A087WP46 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BC034090A0A087WP46 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BC034090A0A087WP46 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
BC034090A0A087WP46 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BC034090A0A087WP46 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BC034090A0A087WP46 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BC034090A0A087WP46 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BC034090A0A087WP46 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BC034090A0A087WP46 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BC034090A0A087WP46 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BC034090A0A087WP46 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BC034090A0A087WP46 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BC034090A0A087WP46 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BC034090A0A087WP46 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
BC034090A0A087WP46 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BC034090A0A087WP46 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BC034090A0A087WP46 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BC034090A0A087WP46 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BC034090A0A087WP46 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BC034090A0A087WP46 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BC034090A0A087WP46 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BC034090A0A087WP46 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BC034090A0A087WP46 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BC034090A0A087WP46 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BC034090A0A087WP46 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BC034090A0A087WP46 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BC034090A0A087WP46 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BC034090A0A087WP46 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
BC034090A0A087WP46 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BC034090A0A087WP46 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BC034090A0A087WP46 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BC034090A0A087WP46 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BC034090A0A087WP46 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BC034090A0A087WP46 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BC034090A0A087WP46 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BC034090A0A087WP46 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BC034090A0A087WP46 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BC034090A0A087WP46 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BC034090A0A087WP46 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BC034090A0A087WP46 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BC034090A0A087WP46 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BC034090A0A087WP46 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BC034090A0A087WP46 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BC034090A0A087WP46 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BC034090A0A087WP46 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BC034090A0A087WP46 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BC034090A0A087WP46 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BC034090A0A087WP46 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BC034090A0A087WP46 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BC034090A0A087WP46 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BC034090A0A087WP46 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BC034090A0A087WP46 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BC034090A0A087WP46 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BC034090A0A087WP46 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BC034090A0A087WP46 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BC034090A0A087WP46 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
BC034090A0A087WP46 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BC034090A0A087WP46 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BC034090A0A087WP46 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BC034090A0A087WP46 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BC034090A0A087WP46 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BC034090A0A087WP46 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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BC034090A0A087WP46 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BC034090A0A087WP46 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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