Protein–RNA interactions for Protein: Q9P270

SLAIN2, SLAIN motif-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAIN2Q9P270 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLAIN2Q9P270 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLAIN2Q9P270 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLAIN2Q9P270 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLAIN2Q9P270 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLAIN2Q9P270 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLAIN2Q9P270 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLAIN2Q9P270 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLAIN2Q9P270 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLAIN2Q9P270 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLAIN2Q9P270 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLAIN2Q9P270 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLAIN2Q9P270 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLAIN2Q9P270 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLAIN2Q9P270 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLAIN2Q9P270 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLAIN2Q9P270 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLAIN2Q9P270 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLAIN2Q9P270 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLAIN2Q9P270 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLAIN2Q9P270 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLAIN2Q9P270 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLAIN2Q9P270 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLAIN2Q9P270 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLAIN2Q9P270 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLAIN2Q9P270 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLAIN2Q9P270 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLAIN2Q9P270 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLAIN2Q9P270 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SLAIN2Q9P270 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLAIN2Q9P270 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLAIN2Q9P270 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLAIN2Q9P270 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLAIN2Q9P270 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLAIN2Q9P270 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLAIN2Q9P270 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLAIN2Q9P270 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms