Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC35.26■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms