Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HCN3Q9P1Z3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms