Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms