Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms