Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHACTR1Q9C0D0 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms