Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR3CQ9BUI4 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms