Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
MCMBPQ9BTE3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms