Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms