Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms