Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms