Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP47Q96K76 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms