Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF4BQ92750 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF4BQ92750 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF4BQ92750 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF4BQ92750 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF4BQ92750 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF4BQ92750 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF4BQ92750 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF4BQ92750 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF4BQ92750 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF4BQ92750 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF4BQ92750 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF4BQ92750 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF4BQ92750 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF4BQ92750 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF4BQ92750 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF4BQ92750 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF4BQ92750 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF4BQ92750 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF4BQ92750 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF4BQ92750 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF4BQ92750 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF4BQ92750 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF4BQ92750 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF4BQ92750 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF4BQ92750 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF4BQ92750 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF4BQ92750 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF4BQ92750 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF4BQ92750 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF4BQ92750 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF4BQ92750 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF4BQ92750 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF4BQ92750 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF4BQ92750 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF4BQ92750 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms