Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms