Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUJ3

CEMIP, Cell migration-inducing and hyaluronan-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEMIPQ8WUJ3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEMIPQ8WUJ3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms