Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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C9orf40Q8IXQ3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf40Q8IXQ3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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