Protein–RNA interactions for Protein: Q71RS6

SLC24A5, Sodium/potassium/calcium exchanger 5, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A5Q71RS6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC24A5Q71RS6 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms