Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms