Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPPQ6IPU0 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms