Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms