Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ODF2Q5BJF6 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms