Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms