Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms