Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
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