Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms