Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms