Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUCB1Q02818 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms